Phylogenetic relationships, recombination analysis, and genetic variability among diverse variants of tomato yellow leaf curl virus in Iran and the Arabian Peninsula: further support for a TYLCV center of diversity

2013 ◽  
Vol 159 (3) ◽  
pp. 485-497 ◽  
Author(s):  
Mohammad Reza Hosseinzadeh ◽  
Masoud Shams-Bakhsh ◽  
Shahrokh Kazempour Osaloo ◽  
Judith K. Brown
2005 ◽  
Vol 95 (5) ◽  
pp. 549-555 ◽  
Author(s):  
C. M. Fauquet ◽  
S. Sawyer ◽  
A. M. Idris ◽  
J. K. Brown

Numerous whitefly-transmitted viral diseases of tomato have emerged in countries around the Nile and Mediterranean Basins the last 20 years. These diseases are caused by monopartite geminiviruses (family Gemini viridae) belonging to the genus Begomovirus that probably resulted from numerous recombination events. The molecular biodiversity of these viruses was investigated to better appreciate the role and importance of recombination and to better clarify the phylogenetic relationships and classification of these viruses. The analysis partitioned the tomato-infecting begomoviruses from this region into two major clades, Tomato yellow leaf curl virus and Tomato yellow leaf curl Sardinia virus. Phylogenetic and pairwise analyses together with an evaluation for gene conversion were performed from which taxonomic classification and virus biodiversity conclusions were drawn. Six recombination hotspots and three homogeneous zones within the genome were identified among the tomatoinfecting isolates and species examined here, suggesting that the recombination events identified were not random occurrences.


EPPO Bulletin ◽  
2002 ◽  
Vol 32 (1) ◽  
pp. 31-35
Author(s):  
A. F. Arsenio ◽  
E. Neto ◽  
N. Ramos ◽  
S. Mangerico ◽  
E. Fortunato ◽  
...  

2020 ◽  
pp. 30-34
Author(s):  
С.Ф. Гавриш ◽  
Т.А. Редичкина ◽  
А.В. Буц ◽  
Г.М. Артемьева

Дана информация об изучении коллекции гибридов F1томата (Solanum lycopersicum L.) зарубежной селекции различных фирм-оригинаторов, рекомендованных производителями семян как толерантные к вирусу желтой курчавости листьев томата. Все гибриды обладали комплексом хозяйственно ценных признаков и набором генов устойчивости к основным заболеваниям томата, в том числе к новому для юга России опасному патогену с максимальным потенциальным риском – вирусу желтой курчавости листьев томата (Tomato yellow leaf curl virus — TYLCV). Исследования проведены в 2017-2018 годах в лаборатории пасленовых культур ООО «НИИСОК» и в лаборатории молекулярной диагностики растений ООО «Семеновод». Всего было протестировано 34 гибрида F1 томата. Гибриды оценивали по совокупности хозяйственно ценных признаков, также проводили молекулярно-генетический анализ на наличие и аллельное состояние основных генов устойчивости: к вирусу табачной мозаики (Tm2а), фузариозному увяданию (I2), вертициллезному увяданию (Ve), к кладоспориозу (Cf9), нематодам (Mi1.2), вирусу бронзовости томата (Sw5), вирусу желтой курчавости листьев томата (Ty3a). Установлено, что все проанализированные гибриды томата с заявленной оригинаторами семян устойчивостью к вирусу желтой курчавости листьев были гетерозиготны по гену Ty3a. На основании проведенных исследований и с учетом требований рынка разработаны модели гибридов F1 томата юга России. Перспективный гибрид томата должен обладать индетерминантным типом роста с укороченными междоузлиями (4,5-5 см) а также хорошей облиственностью. Плоды томата должны быть с красной равномерной окраской без зеленого пятна у плодоножки, с плоскоокруглой или округлой формой плода и со средней массой 220-270 г. Для повышения транспортабельности томатов необходимо, чтобы плоды отличались высокой прочностью и характеризовались хорошей лежкостью. Урожайность гибрида томата должна быть более 30 кг/м2, а товарность - не менее 85%. Гибрид томата должен обладать следующим набором генов устойчивости в гетерозиготном состоянии: Ty3a, Mi1.2, Cf-9, а также в гомозиготном состоянии: Tm2a, I2, Ve. The article provides information on the study of the collection of F1 tomato hybrids (Solanum lycopersicumL.) of foreign breeding from various firms-originators recommended for cultivation in regions with a strong spread of tomato yellow leaf curl virus. All hybrids had a complex of economically valuable traits and a set of genes for resistance to the main diseases of tomato, including a new dangerous pathogen for the South of Russia with a maximum potential risk — the tomato yellow leaf curl virus (TYLCV). The studies were carried out in 2017-2018 in the Solanaceae Laboratory of LLC NIISOK and in the Molecular Diagnostics Laboratory of Plants of LLC Semenovod. A total of 34 F1 tomato hybrids were tested. The hybrids were assessed by a set of economically valuable traits. Molecular genetic analysis was also carried out for the presence and allelic state of the main resistance genes: Tomato mosaic virus (Tm2a), Fusarium wilt (I2), Werticillium wilt (Ve), Cladosporium fulvum (Cf9), Nematodes (Mi1.2), Tomato spotted wilt virus (Sw5), Tomato yellow leaf curl virus (Ty3a). It was found that all the analyzed tomato hybrids with the declared by seed originators resistance to yellow leaf curl virus were heterozygous for the Ty3a gene. Based on the conducted research and taking into account the market requirements, models of F1 tomato hybrids for protected ground for the South of Russia have been developed. A promising tomato hybrid should have an indeterminate growth type with shortened internodes (4.5-5 cm) and good foliage. Tomato fruits should have a uniform red color without green shoulders, with a flat-round or round shape of the fruit and with an average weight of 220-270 g. To increase the transportability of tomatoes, it is necessary that the fruits are highly firm and characterized by good shelf life. The yield of tomato hybrid should be more than 30 kg/m2, and marketability should be at least 85%. The tomato hybrid should have the following set of resistance genes in a heterozygous state: Ty3a, Mi1.2, Cf-9, and also in a homozygous state: Tm2a, I2, Ve.


2015 ◽  
Vol 5 (1) ◽  
Author(s):  
Adi Moshe ◽  
Eduard Belausov ◽  
Annette Niehl ◽  
Manfred Heinlein ◽  
Henryk Czosnek ◽  
...  

2015 ◽  
Vol 5 (1) ◽  
Author(s):  
Nathalie Becker ◽  
Loup Rimbaud ◽  
Frédéric Chiroleu ◽  
Bernard Reynaud ◽  
Gaël Thébaud ◽  
...  

2014 ◽  
Vol 165 (4) ◽  
pp. 1684-1697 ◽  
Author(s):  
Dagan Sade ◽  
Nir Sade ◽  
Oz Shriki ◽  
Stephen Lerner ◽  
Alem Gebremedhin ◽  
...  

Fitoterapia ◽  
2021 ◽  
pp. 104989
Author(s):  
Ning-Dong Zhao ◽  
Yu-Lin Li ◽  
Yu Song ◽  
Bao-Jia Yang ◽  
Xiao Ding ◽  
...  

2017 ◽  
Vol 33 (4) ◽  
pp. 424-428 ◽  
Author(s):  
Eui-Joon Kil ◽  
Jungho Park ◽  
Hong-Soo Choi ◽  
Chang-Seok Kim ◽  
Sukchan Lee

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document