ORTHOSKIM: in silico sequence capture from genomic and transcriptomic libraries for phylogenomic and barcoding applications

2022 ◽  
Author(s):  
Charles Pouchon ◽  
Frédéric Boyer ◽  
Cristina Roquet ◽  
France Denoeud ◽  
Jérome Chave ◽  
...  
Keyword(s):  
In Silico ◽  
Sequence Capture

A systematic review with in silico analysis on transcriptomic profile of gallbladder carcinoma

2020 ◽  
Vol 47 (6) ◽  
pp. 398-408
Author(s):  
Sonam Tulsyan ◽  
Showket Hussain ◽  
Balraj Mittal ◽  
Sundeep Singh Saluja ◽  
Pranay Tanwar ◽  
...  
Keyword(s):  
Systematic Review ◽  
Gallbladder Carcinoma ◽  
In Silico ◽  
In Silico Analysis ◽  
Transcriptomic Profile ◽  
Silico Analysis

Common and well-documented Allele List: unverzichtbares Hilfsmittel für die moderne HLA-Typisierung

2019 ◽  
Vol 9 (04) ◽  
pp. 241-245
Author(s):  
Nils Lachmann ◽  
Diana Stauch ◽  
Axel Pruß
Keyword(s):  
In Silico ◽  
Regionale Unterschiede

ZusammenfassungDie Typisierung der humanen Leukozytenantigene (HLA) vor Organ- und hämatopoetischer Stammzelltransplantation zur Beurteilung der Kompatibilität von Spender und Empfänger wird heutzutage in der Regel molekulargenetisch mittels Amplifikation, Hybridisierung oder Sequenzierung durchgeführt. Durch die exponentiell steigende Anzahl an neu entdeckten HLA-Allelen treten vermehrt Mehrdeutigkeiten, sogenannte Ambiguitäten, in der HLA-Typisierung auf, die aufgelöst werden müssen, um zu einem eindeutigen Ergebnis zu gelangen. Mithilfe kategorisierter Allelfrequenzen (häufig, gut dokumentiert und selten) in Form von CWD-Allellisten (CWD: common and well-documented) ist die In-silico-Auflösung von Ambiguitäten durch den Ausschluss seltener Allele als mögliches Ergebnis realisierbar. Ausgehend von einer amerikanischen CWD-Liste existieren derzeit auch eine europäische, deutsche und chinesische CWD-Liste, die jeweils regionale Unterschiede in den Allelfrequenzen erkennbar werden lassen. Durch die Anwendung von CWD-Allelfiltern in der klinischen HLA-Typisierung können Zeit, Kosten und Arbeitskraft eingespart werden.

In silico strategy for the identification of cyclooxygenase inhibitors from the Thai medicinal mixture Prasaplai

Planta Medica ◽  
2010 ◽  
Vol 76 (12) ◽  
Author(s):  
B Waltenberger ◽  
D Schuster ◽  
S Paramapojn ◽  
W Gritsanapan ◽  
G Wolber ◽  
...  
Keyword(s):  
In Silico ◽  
Cyclooxygenase Inhibitors

microRNA regulation of WISP1 in pulmonary fibrosis: an in silico approach

Pneumologie ◽  
2011 ◽  
Vol 65 (12) ◽  
Author(s):  
B Berschneider ◽  
D Ellwanger ◽  
C Thiel ◽  
V Stümpflen ◽  
M Königshoff
Keyword(s):  
Pulmonary Fibrosis ◽  
In Silico ◽  
Microrna Regulation

Mechanisms of action of antihyperglycemic mexicanolides isolated from Swietenia humillis: in vivo and in silico approaches

Planta Medica ◽  
2016 ◽  
Vol 81 (S 01) ◽  
pp. S1-S381 ◽  
Author(s):  
B Ovalle-Magallanes ◽  
A Madariaga-Mazón ◽  
A Navarrete ◽  
R Mata
Keyword(s):  
In Silico ◽  
Mechanisms Of Action
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