In silico analysis on structure and DNA binding mode of AtNAC1, a NAC transcription factor from Arabidopsis thaliana

2014 ◽  
Vol 20 (3) ◽  
Author(s):  
Qiankun Zhu ◽  
Jiaxin Zou ◽  
Mengli Zhu ◽  
Zubi Liu ◽  
Peichun Feng ◽  
...  
Keyword(s):  
Arabidopsis Thaliana ◽  
Transcription Factor ◽  
Dna Binding ◽  
In Silico ◽  
In Silico Analysis ◽  
Binding Mode ◽  
Nac Transcription Factor ◽  
Silico Analysis

scholarly journals IN SILICO ANALYSIS OF THE Dof TRANSCRIPTION FACTOR FAMILY IN Coffea canephora

2018 ◽  
Vol 14 (4) ◽  
pp. 99-111
Author(s):  
Vinícius Garcia ◽  
Alessandra Ferreira Ribas ◽  
Luiz Gonzaga Esteves Vieira ◽  
Tiago Benedito dos Santos
Keyword(s):  
Transcription Factor ◽  
Dna Binding ◽  
In Silico ◽  
In Silico Analysis ◽  
Coffea Canephora ◽  
Transcription Factor Family ◽  
Dof Transcription Factor ◽  
Silico Analysis

A família Dof(DNA-binding with One Finger) é um grupo de fatores de transcrição que desempenham papéis importantes no crescimento, desenvolvimento e na resposta das plantas aos estresses bióticos e abióticos. Os genes Dofforam identificados e caracterizados em várias espécies de plantas;entretanto até o presente momento não há informações sobre esses genes em café. No presente estudo foram identificados 24 membros da família Dofno genoma de C. canephoradepositados no banco de dados Coffee Genome Hub. Análises sistemáticas de bioinformática foram realizadas para caracterizar os genes DofemC. canephora, incluindo a análise desequênciasgenômicas, domínios proteicos conservados, localizações subcelulares, relações filogenéticas e perfis de expressão gênica em diferentes tecidos. Os resultados obtidos fornecem uma melhor compreensãosobre a família dos genes CcDofpermitindo projetar experimentos futuros para caracterização molecular dessesgenes no cafeeiro.

scholarly journals Class A β-lactamases and inhibitors: In silico analysis of the binding mode and the relationship with resistance

2018 ◽  
Vol 279 ◽  
pp. 37-46
Author(s):  
Rebeca Pereira ◽  
Vitor Won-Held Rabelo ◽  
Alexander Sibajev ◽  
Paula Alvarez Abreu ◽  
Helena Carla Castro
Keyword(s):  
In Silico ◽  
In Silico Analysis ◽  
Binding Mode ◽  
Class A ◽  
The Relationship ◽  
Silico Analysis

Appraisal of H2S metabolism in Arabidopsis thaliana: In silico analysis at the subcellular level

2020 ◽  
Vol 155 ◽  
pp. 579-588
Author(s):  
Salvador González-Gordo ◽  
José M. Palma ◽  
Francisco J. Corpas
Keyword(s):  
Arabidopsis Thaliana ◽  
In Silico ◽  
In Silico Analysis ◽  
Subcellular Level ◽  
Silico Analysis

scholarly journals In silico Analysis of Transcription Factor Repertoire and Prediction of Stress Responsive Transcription Factors in Soybean

DNA Research ◽  
2009 ◽  
Vol 16 (6) ◽  
pp. 353-369 ◽  
Author(s):  
K. Mochida ◽  
T. Yoshida ◽  
T. Sakurai ◽  
K. Yamaguchi-Shinozaki ◽  
K. Shinozaki ◽  
...  
Keyword(s):  
Transcription Factor ◽  
Transcription Factors ◽  
In Silico ◽  
In Silico Analysis ◽  
Silico Analysis

scholarly journals In Silico Analysis of Transcription Factor Repertoires and Prediction of Stress-Responsive Transcription Factors from Six Major Gramineae Plants

DNA Research ◽  
2011 ◽  
Vol 18 (5) ◽  
pp. 321-332 ◽  
Author(s):  
K. Mochida ◽  
T. Yoshida ◽  
T. Sakurai ◽  
K. Yamaguchi-Shinozaki ◽  
K. Shinozaki ◽  
...  
Keyword(s):  
Transcription Factor ◽  
Transcription Factors ◽  
In Silico ◽  
In Silico Analysis ◽  
Silico Analysis

Functional prediction of a T-DNA tagged gene of Arabidopsis thaliana by in silico analysis

2004 ◽  
Vol 10 (2) ◽  
pp. 130-138 ◽  
Author(s):  
Maria Svensson ◽  
Dan Lundh ◽  
Mikael Ejdeb�ck ◽  
Abul Mandal
Keyword(s):  
Arabidopsis Thaliana ◽  
In Silico ◽  
In Silico Analysis ◽  
Functional Prediction ◽  
Silico Analysis
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