scholarly journals Bacterial resistance trends among intraoperative bone culture of chronic osteomyelitis in an affiliated hospital of South China for twelve years

2019 ◽  
Vol 19 (1) ◽  
Author(s):  
Xianghong Zhang ◽  
Qiong Lu ◽  
Tang Liu ◽  
Zhihong Li ◽  
Weiliang Cai
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Staphylococcus Aureus ◽  
Pseudomonas Aeruginosa ◽  
South China ◽  
Chronic Osteomyelitis ◽  
Enterobacter Cloacae ◽  
Bone Culture ◽  
Acinetobacter Baumanii ◽  
Unified Protocol ◽  
Positive Rate

Abstract Background The purpose of this study was to gather temporal trends on bacteria epidemiology and resistance of intraoperative bone culture from chronic ostemyelitis at an affiliated hospital in South China. Method Records of patients with chronic osteomyelitis from 2003 to 2014 were retrospectively reviewed. The medical data were extracted using a unified protocol. Antimicrobial susceptibility testing was carried out by means of a unified protocol using the Kirby-Bauer method, results were analyzed according to Clinical and Laboratory Standards Institute definitions. Result Four hundred eighteen cases met our inclusion criteria. For pathogen distribution, the top five strains were Staphylococcus aureus (27.9%); Pseudomonas aeruginosa (12.1%); Enterobacter cloacae (9.5%); Acinetobacter baumanii (9.0%) and Escherichia coli (7.8%). Bacterial culture positive rate was decreased significantly among different year-groups. Mutiple bacterial infection rate was 28.1%. One strain of Staphylococcus aureus was resistant to linezolid and vancomycin. Resistance of Pseudomonas aeruginosa stains to Cefazolin, Cefuroxime, Cefotaxime, and Cefoxitin were 100% nearly. Resistance of Acinetobacter baumanii stains against Cefazolin, Cefuroxime were 100%. Ciprofloxacin resistance among Escherichia coli isolates increased from 25 to 44.4%. On the contrary, resistance of Enterobacter cloacae stains to Cefotaxime and Ceftazidime were decreased from 83.3 to 36.4%. Conclusions From 2003 to 2014, positive rate of intraoperative bone culture of chronic osteomyelitis was decreased; the proportion of Staphylococcus aureus was decreased gradually, and our results indicate the importance of bacterial surveilance studies about chronic osteomyelitis.

scholarly journals Fatores de risco e perfil do uso de antimicrobianos entre pacientes com infecção no trato urinário em uma unidade de terapia intensiva

2021 ◽  
Vol 10 (3) ◽  
pp. e43910313516
Author(s):  
Lucas Harassim ◽  
Olibio Lopes Fiebig da Silva ◽  
Luiz Felipe Soares Pinheiro ◽  
Elber José Assaiante dos Santos ◽  
Cláudio Daniel Cerdeira ◽  
...  
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Staphylococcus Aureus ◽  
Pseudomonas Aeruginosa ◽  
Klebsiella Oxytoca ◽  
Enterobacter Aerogenes ◽  
Enterobacter Cloacae ◽  
Citrobacter Freundii ◽  
Providencia Rettgeri ◽  
E Coli ◽  
Terapia Intensiva

A Infecção no Trato Urinário (ITU) acometendo pacientes em Unidades de Terapia Intensiva (UTIs) é uma realidade preocupante, agravada pelo uso irracional de antimicrobianos e a alarmante multirresistência em microrganismos. Nós avaliamos o nível de assertividade quanto ao uso de antimicrobianos durante à antibioticoterapia empírica (ATE), em pacientes diagnosticados com ITU, comparando tal tratamento farmacológico empírico e o realizado após o antibiograma (antibioticoterapia direcionada), além disto, estimamos a prevalência dos agentes etiológicos e analisamos os fatores de risco associados. Este é um estudo observacional e transversal, realizado em 2015, no qual foram avaliados pacientes de ambos os sexos e todas as idades apresentando ITU e submetidos à antibioticoterapia, internados em uma UTI de um hospital no sul de Minas Gerais, Brasil. Dos 49 pacientes avaliados (28 mulheres [M] e 21 homens [H]), a média de idade foi 55±19 anos (IC(95) 49-61) e a faixa etária ≥70 anos foi a predominante. Quatorze diferentes microrganismos foram causadores de ITUs, sendo que 28,3% (IC(95%) 16,2-40,4) dos isolados clínicos tiveram Escherichia coli como o agente etiológico (33,3% H e 28,6% M); 18,9% (IC(95%) 8,3-29,4) Acinetobacter baumannii (33,3% H e 10,7% M); 15,1% (IC(95%) 5,5-24,7) Klebsiella pneumoniae (19% H e 14,3% M); 11,3% Pseudomonas aeruginosa (9,5% H e 14,3% M); 5,7% Enterobacter aerogenes (14,3% H); 3,8% Klebsiella oxytoca; 3,8% Staphylococcus aureus (7,1% M); e 1,9% para cada um dos seguintes microrganismos: Enterococcus faecalis (4,8% H); Proteus mirabilis (3,6% M); Enterobacter cloacae (3,6% M); Providencia rettgeri (4,8% H); Citrobacter koseri (3,6% M); Citrobacter freundii (3,6% M); e Fungos leveduriformes (4,8% H). As prevalências de ITUs causadas por A. baumannii e P. aeruginosa foram influenciadas pelo sexo (χ² com p<0,001). No sexo masculino, houve correlações positivas “substanciais” entre o aumento da idade (em anos) e a prevalência de ITU causada por E. coli (r = 0,69) ou entre idades menos avançadas e a prevalência de ITU causada por A. baumannii (r = -0,7). No sexo feminino, houve uma correlação positiva “extremamente forte” entre o aumento da idade e a prevalência de ITU causada por E. coli (r = 0,94; IC(95) 0,66-0,99; p<0,0014). Os antibióticos mais utilizados de forma empírica (ATE) foram: Ciprofloxacina (14,3% IC(95%) 4,7-24,1), Cefepima (14,3%) e Vancomicina (10%), e após o antibiograma (antibioticoterapia direcionada): Ceftazidima (16,3% IC(95%) 6-26,7), Ciprofloxacina (14,3% IC(95%) 4,5-24,1), Polimixina B (10,2%), Imipenem (10,2%) e Ampicilina + Sulbac. (8,2%). Em 20% dos casos, as terapias empíricas (ATE) foram consideradas “inapropriadas/não acertadas”. Contudo, também devemos ter ciência da necessidade clínica e quanto ao imediatismo para o tratamento de uma ITU em UTI, uma vez que a doença pode ser fatal se uma terapia não for instituída, portanto, nós aconselhamos avaliações mais minuciosas, tanto da racionalidade do uso de antibióticos, quanto dos fatores de risco para o desenvolvimento de ITUs em UTIs.

scholarly journals Profil Penggunaan Antibiotik dan Peta Kuman pada Pasien Gangren Diabetes Melitus di Sebuah RSUD di Kabupaten Gresik

2020 ◽  
Vol 3 (2) ◽  
pp. 96
Author(s):  
Isna Romadhona ◽  
Fauna Herawati ◽  
Rika Yulia
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Staphylococcus Aureus ◽  
Pseudomonas Aeruginosa ◽  
Klebsiella Pneumoniae ◽  
Acinetobacter Baumannii ◽  
Proteus Mirabilis ◽  
Enterobacter Aerogenes ◽  
Enterobacter Cloacae ◽  
Proteus Vulgaris ◽  
Diabetes Melitus

Antibiotik merupakan obat yang digunakan untuk mengatasi dan mencegah infeksi bakteri. Penggunaan antibiotik yang tidak tepat dapat menimbulkan berbagai masalah, diantaranya pengobatan akan lebih mahal dan juga risiko terjadinya resistensi bakteri terhadap antibiotik. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui profil penggunaan antibiotik dan profil peta kuman pada pasien gangren diabetes melitus di sebuah RSUD di Kabupaten Gresik serta untuk mengetahui kesesuaian penggunaan antibiotik dengan mengacu pada Permenkes Republik Indonesia No. 2406/Menkes/PER/XII/2011. Data penggunaan antibiotik diperoleh dari catatan Rekam Medis pada periode Januari – November 2017. Data penggunaan antibiotik dihitung dengan menggunakan rumus DDD/100 pasien-hari rawat. Hasil perhitungan DDD/100 pasien-hari rawat menunjukkan hasil sebesar 470,11 DDD/100 pasien-hari rawat. Peta kuman pada pasien gangren, melaporkan adanya bakteri Enterobacter cloacae 24%, Escherichia coli 18%, Staphylococcus aureus 15%, Acinetobacter baumannii 9%, Pseudomonas aeruginosa 6%, Citrobacter youngae 6%, Enterobacter aerogenes 6%, Proteus vulgaris 6%, Staphylococcus schleiferi 6%, Klebsiella pneumoniae 3%, dan Proteus mirabilis 3% . Penggunaan antibiotik seftriakson dan metronidazol pada pasien gangren diabetes melitus di sebuah RSUD di Kabupaten Gresik pada periode Januari – November 2017 telah sesuai dengan pedoman penggunaan antibiotik berdasarkan Permenkes Republik Indonesia No. 2406/Menkes/PER/ XII/2011, yaitu antibiotik golongan sefalosporin generasi III yang lebih aktif terhadap Enterobacteriaceae dan antibiotik golongan nitroimidazol yang dapat mengobati infeksi bakteri basil anerob Gram-Negatif.

Chemical Composition and Antimicrobial Activity of Salvia x jamensis Essential Oil

2012 ◽  
Vol 7 (9) ◽  
pp. 1934578X1200700 ◽  
Author(s):  
Daniele Fraternale ◽  
Guido Flamini ◽  
Angela Bisio ◽  
Maria Cristina Albertini ◽  
Donata Ricci
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Staphylococcus Aureus ◽  
Pseudomonas Aeruginosa ◽  
Antimicrobial Activity ◽  
Chemical Composition ◽  
Essential Oil ◽  
Bacillus Cereus ◽  
Enterobacter Cloacae ◽  
Caryophyllene Oxide ◽  
First Report

This is the first report about the composition of the essential oil of Salvia x jamensis. The major compounds identified by GC-MS were β-caryophyllene (14.8 %), β-pinene (6.8 %), caryophyllene oxide (6.0 %), δ-cadinene (5.5 %), α-pinene (5.2 %) and spatulenol (5.2 %). The oil showed antimicrobial activity against three Gram (+) bacteria: Bacillus cereus, Staphylococcus aureus, and S. epidermidis, and three Candida strains: C. albicans, C. glabrata and C. tropicalis, while it was inactive against three Gram (-) bacteria: Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli and Enterobacter cloacae.

scholarly journals Prevalência de microrganismos em culturas de catéter

2018 ◽  
Vol 17 (2) ◽  
pp. 147
Author(s):  
Nathalia Calabresi ◽  
Leyde Daiane de Peder ◽  
Heloise Skiavine Madeira ◽  
Bruna Larissa Nascimento ◽  
Denise Michelle Indras ◽  
...  
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Staphylococcus Aureus ◽  
Pseudomonas Aeruginosa ◽  
Candida Albicans ◽  
Klebsiella Pneumoniae ◽  
Acinetobacter Baumanii

<p>Os cateteres intravenosos são de uso amplamente difundido em hospitais e por estarem em contato direto com a circulação sanguínea, tornam-se um potencial risco para a ocorrência de contaminação e infecção local e sistêmica, aumentando a mortalidade, o tempo de internação e consequentemente custos hospitalares. O presente estudo teve como objetivo realizar levantamento epidemiológico da prevalência de bactérias em pontas de cateteres provenientes de sete hospitais do município de Cascavel - Paraná. Foi realizado um estudo transversal por meio da coleta de dados em laudos emitidos por um laboratório clínico privado do mesmo município, entre os anos de 2011 a 2014. Verificou-se positividade em 21,68% dos laudos analisados (248). O grupo dos bacilos Gram negativos (BGN) foi o mais prevalente, sendo as principais bactérias encontradas <em>Escherichia coli</em> e <em>Klebsiella pneumoniae</em> (84 laudos), seguidos de BGN não-fermentadores (79 laudos) e cocos Gram positivos (67 laudos). Leveduras foram encontradas em 18 laudos. <em>Staphylococcus aureus</em> apresentaram uma resistência de 31,81% para oxacilina, sendo para <em>Staphylococcus</em> coagulase-negativa resistência de 86,96%. <em>Klebsiella pnemoniae</em> apresentou discreta resistência para ertapenem (9,52%), imipenem (7,14%) e meropenem (7,14%), sugerindo presença de carbapenemase. Espécies de <em>Enterobacter</em> foram resistentes a diversos antimicrobianos, não constatado resistência aos carbapenêmicos ertapenem, imipenem e meropenem. <em>Acinetobacter baumanii</em> e <em>Pseudomonas aeruginosa</em> apresentaram elevada resistência para imipenem e meropenem (77,14% e 45,16%; 80% e 51,61%, respectivamente). <em>Candida albicans</em> apresentou 100% de suscetibilidade aos antifúngicos utilizados. Esses resultados demonstram a grande importância no manejo eficiente do controle de infecção hospitalar e uso responsável de antimicrobianos por hospitais.</p>

scholarly journals Actividad antimicrobiana de cuatro variedades de plantas frente a patógenos de importancia clínica en Colombia

Nova ◽  
2017 ◽  
Vol 15 (27) ◽  
pp. 119 ◽  
Author(s):  
Cristian Nicolás Rodríguez Pava ◽  
Andrés Gabriel Zarate Sanabria ◽  
Ligia Consuelo Sánchez Leal
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Staphylococcus Aureus ◽  
Pseudomonas Aeruginosa ◽  
Candida Albicans ◽  
Streptococcus Pneumoniae ◽  
Eichhornia Crassipes ◽  
Enterobacter Cloacae ◽  
Taraxacum Officinale ◽  
Sambucus Nigra ◽  
Providencia Rettgeri

<p>Objetivo. Evaluar la actividad antimicrobiana de los extractos de las plantas Bauhinia sp., Sambucus nigra, Eichhornia crassipes y Taraxacum officinale frente a patógenos de importancia clínica. Método. La metodología incluyó la adquisición, secado, maceración, molienda, preparación de los extractos crudos etanólicos y concentración por rotaevaporación, análisis fitoquimico y se<br />separaron las fracciones por cromatografía en capa fina. Las pruebas antimicrobianas se realizaron con diferentes concentraciones de los extractos según las indicaciones de Clinical and Laboratory Standars Institute. Los microorganismos utilizados fueron Enterococcus faecium resistente a<br />vancomicina, Streptococcus pneumoniae, Klebsiella pneumoniae con presencia de KPC, Providencia rettgeri con presencia de ESBLs, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter cloacae, Escherichia coli, Staphylococcus aureus β-lisina y Candida albicans. Resultados. Las cromatografías permitieron comprobar la presencia de flavonoides, terpenos, saponinas, fenoles, quinonas y alcaloides que han<br />sido reportados con actividad antimicrobiana. En los ensayos de susceptibilidad antimicrobiana se encontró que los extractos presentaban diversos grados de inhibición frente a los microrganismos de estudio, siendo el más eficaz los tallos de T. officinale. Conclusión. Se puede concluir que los extractos vegetales podrían ser una alternativa de tratamiento para infecciones nosocomiales.</p>

scholarly journals Microoganismos patógenos más frecuentemente aislados de infecciones en pacientes internados en el Hospital de Traumatología y Ortopedia IMSS de la ciudad de Puebla

2021 ◽  
Vol 2 (2) ◽  
pp. 3299-3310
Author(s):  
Galicia Grande Alejandro ◽  
Villagrán Padilla Claudy ◽  
Suárez Albores Patricia ◽  
Ruiz Tagle Alejandro ◽  
Nava Rodriguez I.
Keyword(s):  
Staphylococcus Aureus ◽  
Pseudomonas Aeruginosa ◽  
Streptococcus Pyogenes ◽  
Staphylococcus Epidermidis ◽  
Enterobacter Cloacae ◽  
Citrobacter Freundii ◽  
Pseudomonas Sp ◽  
Acinetobacter Baumanii ◽  
E Coli ◽  
Buenas Prácticas

Las infecciones intrahospitalarias (IHH) se consideran de gran importancia en pacientes internados en el hospital de traumatología y ortopedia IMSS debido a que es uno de los grandes problemas que se presenta en los pacientes y experimenta en algún momento durante su estancia. El cultivo bacteriológico es un método específico y confiable para su diagnóstico. Como propósito de este estudio se tiene el determinar la frecuencia de microorganismos patógenos aislados en cultivos de infecciones a pacientes internados en el hospital de traumatología y ortopedia IMSS de la ciudad de Puebla. Se realizó un estudio de tipo transversal, prospectivo, y observacional para 844 muestras de infecciones provenientes de diversas áreas anatómicas provenientes de pacientes que se encuentran internados en el hospital de traumatología y ortopedia IMSS de la Ciudad de Puebla, en el periodo enero 2015 a diciembre 2015. A cada muestra se le realizó un cultivo bacteriológico, así mismo se procedió a la identificación del agente microbiano, y realización de antibiograma. Respecto al cultivo bacteriológico, el microorganismo más aislado fue E. coli con un 23%, seguido de Staphylococcus aureus 17%, Staphylococcus epidermidis 12%, Staphylococcus haemolyticus 9%, Pseudomonas aeruginosa 5%, Klebsiella pneumoniae 5%, Acinetobacter baumanii 5%, Enterobacter cloacae 5%, Enterobacter faecalis 4%, Staphylococcus coagulasa neg. 2%, Streptococcus pyogenes 19%, Morganella morgani 2%, Proteus mirabilis 1%, Pseudomonas sp. y Candida albicans ambas con 0.9%, Serratia marcescens 0.5%, Citrobacter freundii 0.4%. Bacterias de interés clínico ya que estas son causantes de infecciones que complican la salud de los pacientes. El antibiograma fue realizado a los cultivos positivos conforme a las solicitud requisitada, dio como resultado una baja sensibilidad en bacterias tanto grampositivas y gramnegativas, esto demuestra que las bacterias están mostrando resistencia a los antibióticos, debido a la administración y mal manejo de antibióticos de amplio espectro en los pacientes ya que en la mayoría de los casos el médico inicia el tratamiento sin tener un cultivo y antibiograma previo para tener un control de los medicamentos administrados. De acuerdo con los resultados obtenidos, se concluye que los cultivos bacteriológicos nos dieron información importante con respecto a este estudio en cuanto a que la presencia de E. coli nos da a entender que hay malas prácticas de higiene en cuanto a procedimientos médicos y manejo de los pacientes, pero también nos muestra un problema actual el cual es la resistencia de las bacterias a los antibióticos, siendo este un problema urgente que se debe de erradicar con información y buenas prácticas higiénicas.

scholarly journals Study the Antimicrobial effect of Kombucha tea on bacteria isolated from Diabetic foot ulcer

2014 ◽  
Vol 8 (4) ◽  
pp. 27-33
Author(s):  
E. J. AL-Kalifawi
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Staphylococcus Aureus ◽  
Pseudomonas Aeruginosa ◽  
Klebsiella Pneumoniae ◽  
Enterococcus Faecalis ◽  
Proteus Mirabilis ◽  
Staphylococcus Epidermidis ◽  
Enterobacter Cloacae ◽  
Proteus Vulgaris ◽  
Kombucha Tea

The study was conducted from January to March 2012. In this study colorimetric VITEK-2 Compact system used for its accuracy and rapidity to identify isolates and to detect several antimicrobial resistances.The study also investigate the antibacterial effect of Kombucha tea on isolated bacteria from diabetic foot ulcer. The bacteria isolated were eight gram negative bacteria, namely, Acinetobacter baumannii 3 (2%), Enterobacter cloacae 5 (4%), Escherichia coli 13 (10%), Klebsiella pneumoniae 7 (6%), Citrobacter spp. 4 (3%), Proteus mirabilis 3 (2%), Proteus vulgaris 3 (2%) and Pseudomonas aeruginosa 44 (35%). Four gram positive bacterium, Enterococcus faecalis 6 (5%), Staphylococcus aureus 17 (13%), Staphylococcus epidermidis 13 (10%) and Streptococcus spp. 9 (8%). The antimicrobial activities of antibiotics showed that, all isolates are sensitive to Ciprofloxacin, Levofloxacin and Ofloxacin. The resistance to other types of antimicrobial differ with different isolate. The effect of Kombucha tea on all isolates wasclear at 7days of incubation; the diameter of inhibition was 6mm for Acinetobacter baumannii, Proteus vulgaris and Enterococcus faecalis. 7mm for Enterobacter cloacae, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Citrobacter spp., Staphylococcus epidermidis and Streptococcus spp. 8mm for Proteus mirabilis, Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus. The maximum activity of fermented tea was recorded at 14days incubation of Kombucha organism against all isolates, the diameter of inhibition was 21mm for Acinetobacter baumannii, 24mm for Enterobacter cloacae, 23mm for Escherichia coli, Staphylococcus epidermidis and Streptococcus spp., 16mm for Klebsiella pneumoniae, 22mm for Citrobacter spp. and Enterococcus faecalis, 25mm for Proteus mirabilis and Staphylococcus aureus, 20mm for Proteus vulgaris, 26mm for Pseudomonas aeruginosa. The antibacterial activity of Kombucha tea decrease with increase incubation periods28 days.

scholarly journals Ocorrência e perfil bacteriano de culturas coletadas em pacientes internados na unidade de terapia intensiva em um hospital terciário

HU Revista ◽  
2019 ◽  
Vol 45 (2) ◽  
pp. 122-133
Author(s):  
Carine Rosa Naue ◽  
Tércio Ribeiro ◽  
Rafaella Ribeiro ◽  
Katia Batista ◽  
Samuel Aquino
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Staphylococcus Aureus ◽  
Pseudomonas Aeruginosa ◽  
Klebsiella Pneumoniae ◽  
Acinetobacter Baumannii ◽  
Enterobacter Cloacae ◽  
Terapia Intensiva

Introdução: O ambiente da UTI é considerado o foco das infecções relacionadas à assistência à saúde (IRAS). Isso deve-se a particularidades desse ambiente como a utilização de dispositivos invasivos, uso de imunossupressores, período de internação prolongado, colonização por micro-organismos resistentes, prescrição de antimicrobianos e a própria característica do ambiente da UTI, além da condição clínica do paciente. O conhecimento do perfil bacteriano de cada cultura norteia a equipe médica no tratamento inicial das infecções. Objetivo: O objetivo desse trabalho foi verificar a ocorrência e o perfil bacteriano presente em pacientes internados na UTI de um hospital universitário. Material e métodos: O estudo foi realizado através da análise de exames de secreções traqueais, hemoculturas e uroculturas de pacientes internados no período de janeiro a junho de 2018. Os dados foram coletados por meio de impressos laboratoriais do próprio serviço e tabulados na planilha do Excel®, sendo divididos em amostras positivas e negativas, e realizada análise descritiva com valores absolutos e percentuais. Resultados: Em geral, as bactérias de maior ocorrência foram Acinetobacter baumannii (20,3%), Pseudomonas aeruginosa (19,7%), Klebsiella pneumoniae (15,1%), Staphylococcus aureus (11,9%), Staphylococcus coagulase negativa (7,2%) e Escherichia coli (5,7%). As espécies bacterianas com maior resistência foram Acinetobacter baumanni, Klebisiella pneumoniae, aPseudomonas aeruginosa, Eschericia coli, Serratia marcencens e Enterobacter cloacae. Conclusão: Os dados deste trabalho permitem o conhecimento do perfil bacteriano encontrado nos pacientes internados, o que poderá nortear o tratamento das infecções e consequentemente diminuir a seleção de bactérias multirresistentes, auxiliando na prevenção e no controle das infecções hospitalares.

scholarly journals Distribution of Antimicrobial Resistance and Virulence Genes within the Prophage-Associated Regions in Nosocomial Pathogens

mSphere ◽  
2021 ◽  
Author(s):  
Kohei Kondo ◽  
Mitsuoki Kawano ◽  
Motoyuki Sugai
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Staphylococcus Aureus ◽  
Pseudomonas Aeruginosa ◽  
Antimicrobial Resistance ◽  
Horizontal Gene Transfer ◽  
Virulence Genes ◽  
Genetic Material ◽  
Enterobacter Cloacae ◽  
Genome Sequences ◽  
Content Type

Although we believe phages play an important role in horizontal gene transfer in exchanging genetic material, we do not know the distribution of the antimicrobial resistance (AMR) and/or virulence factor (VF) genes in prophages. We collected different prophage elements from the complete genome sequences of seven species— Enterococcus faecium , Staphylococcus aureus , Klebsiella pneumoniae , Acinetobacter baumannii , Pseudomonas aeruginosa , Enterobacter cloacae , and Escherichia coli —and characterized the distribution of antimicrobial resistance and virulence genes encoded in the prophage region.

Identificación molecular de microorganismos aislados de quesera artesanal ubicada en la Libertad-Chontales, Nicaragua

2020 ◽  
Vol 10 (2) ◽  
pp. 62-78
Author(s):  
Heysell Dodanig Delgado Silva ◽  
Leandro Alberto Páramo Aguilera
Keyword(s):  
Escherichia Coli ◽  
Staphylococcus Aureus ◽  
Pseudomonas Aeruginosa ◽  
Klebsiella Pneumoniae ◽  
Bacillus Cereus ◽  
Serratia Marcescens ◽  
Enterobacter Cloacae ◽  
Pseudomonas Sp ◽  
Rhodotorula Mucilaginosa ◽  
Proteus Vulgaris

En la producción quesera artesanal de Nicaragua coexisten un sin número de microorganismos que no han sido estudiados, y muchas veces no se considera como intervienen en la producción del queso. Por tal razón, en este trabajo se aislaron microorganismos de una quesera artesanal en medios de cultivos básicos AN, LB, PCA, PDA y AM con el objeto de aislar una amplia cantidad de microorganismos. Una vez aislados y purificados los cultivos se obtuvieron 82 bacterias, 3 hongos levaduriformes y 12 hongos filamentosos. Mediante el análisis morfológico de las características macro y microscópicas se seleccionaron 16 morfotipos que incluían bacterias y hongos, para la identificación molecular mediante la extracción del ADN, la amplificación por la PCR y la secuenciación de las regiones 16S para bacterias, ITS para hongos filamentosos y los dominios D1/D2/D3 para las levaduras. Se logró identificar 20 aislados a nivel de especie: Bacillus cereus (1), Enterobacter cloacae (1), Escherichia coli (1), Klebsiella pneumoniae (2), Planococcus maritimus (1), Proteus vulgaris (1), Pseudomonas aeruginosa (2), Psychrobacter alimentarius (1), Serratia marcescens (3), Staphylococcus aureus (1), Cybelindnera jadinii (2), Rhodotorula mucilaginosa (1), Candida pararugosa (1), Aspergillus hiratsukae (1) y Trichoderma orientale (1). Además, se identificaron 7 bacterias a nivel de género: Enterobacter sp (4), Escherichia sp (1), Klebsiella pneumoniae (1) y Pseudomonas sp (1). La presente investigación contribuirá al avance del conocimiento de los microorganismos presentes en el proceso de producción de una quesera artesanal, permitiendo la selección y utilización de estos para su aplicación en procesos biotecnológicos.

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